हालांकि औद्योगिक कंप्यूटर और केंद्रीय नियंत्रक बहुत समान हैं, फिर भी कुछ अंतर हैं:

विभिन्न उपयोग: औद्योगिक नियंत्रण कंप्यूटर का उपयोग आमतौर पर औद्योगिक नियंत्रण प्रणालियों में स्वचालन नियंत्रण और डेटा अधिग्रहण और प्रसंस्करण के लिए किया जाता है; केंद्रीय नियंत्रक का उपयोग आमतौर पर बड़ी इमारतों या स्मार्ट घरों की केंद्रीय नियंत्रण प्रणाली के लिए किया जाता है, जो पूरे उपकरण या प्रणाली के संचालन को नियंत्रित करने के लिए जिम्मेदार होता है।

विभिन्न प्रसंस्करण क्षमताएं: वास्तविक समय डेटा को संसाधित करने की आवश्यकता के कारण, औद्योगिक नियंत्रण कंप्यूटरों को उच्च प्रसंस्करण क्षमताओं और तेज प्रतिक्रिया गति की आवश्यकता होती है; हालांकि, केंद्रीय नियंत्रक को आमतौर पर बड़ी मात्रा में डेटा और वास्तविक समय नियंत्रण को संसाधित करने की आवश्यकता नहीं होती है, और इसकी प्रसंस्करण क्षमता अपेक्षाकृत कम होती है।

विभिन्न विस्तार क्षमता: औद्योगिक नियंत्रण कंप्यूटरों में आमतौर पर मजबूत विस्तार क्षमता होती है और आवश्यकतानुसार अधिक स्लॉट, इंटरफेस और मॉड्यूल जोड़े जा सकते हैं; केंद्रीय नियंत्रक आमतौर पर अपेक्षाकृत निश्चित होता है, इसमें विस्तार क्षमता कमजोर होती है, और शायद ही कभी अपग्रेड करने का अवसर मिलता है।

विभिन्न कार्य वातावरण: औद्योगिक कंप्यूटर आमतौर पर कठोर औद्योगिक वातावरण में उपयोग किए जाते हैं जिनके लिए उच्च स्थायित्व और विश्वसनीयता की आवश्यकता होती है, जबकि केंद्रीय नियंत्रक घरों या कार्यालयों जैसे स्थिर वातावरण में अधिक सामान्य रूप से उपयोग किए जाते हैं।

विभिन्न हार्डवेयर कॉन्फ़िगरेशन: औद्योगिक नियंत्रण कंप्यूटरों में आमतौर पर सख्त हार्डवेयर कॉन्फ़िगरेशन आवश्यकताएं होती हैं, जिनमें विद्युत चुम्बकीय हस्तक्षेप प्रतिरोध, धूल से बचाव, जल प्रतिरोध और शॉक प्रतिरोध जैसी विशेषताएं शामिल होती हैं; हालांकि, केंद्रीय नियंत्रक को आमतौर पर इन सुविधाओं की आवश्यकता नहीं होती है।